據新加坡《聯合早報》網站12日報道，埃及軍事委員會譴責科普特基督教徒與軍警之間的暴力沖突事件是“一次破壞國家的企圖”，并警告軍方將采取措施嚴厲鎮壓，來保障國家和平。
歐洲國家、美國和聯合國秘書長潘基文對沖突事件表示震驚，呼吁埃及全面調查這起沖突。他們也提醒埃及政府必須維護國內各宗教信仰者的安全。
埃及總理謝拉夫說，政府將成立以司法部長為首的尋求事實委員會展開調查，揪出幕后黑手。政府還決定委托國家司法委員會就政府制定的宗教場所法案開展社會對話，以便在兩周內批準這一法案，同時增加對宗教歧視的懲罰條款。
9日的沖突是8個月前埃及發生針對前總統穆巴拉克的示威浪潮以來，最嚴重的沖突。沖突共造成25人喪命，當中大部分是科普特基督教徒。
埃及科普特教會嚴厲批評政府鎮壓示威者的做法，并指責政府沒能阻止反基督教徒分子滋事，以致和平示威演變成致命的宗教沖突。
教會聲明說：“陌生人摻雜在我們的教徒當中，以致教徒得為他們犯下的錯負責。教會認為問題一再發生，而加害者卻沒有受到懲罰。”
據介紹，埃及的科普特教徒僅占其8500萬人口的大約10%，但卻是中東最大的基督教社群。分析認為，埃及在后穆巴拉克時代陷入“安全真空”，導致基督教徒面對日益強大的伊斯蘭主義運動的威脅。
備受批評的埃及軍事委員會發布措詞嚴厲的聲明，稱將對未來的示威施以更為嚴厲的鎮壓。
聲明稱，軍事委員會將采取“必要預防措施以鞏固安全”，使用法律的全部力量懲罰卷入暴亂的個人，無論是參與者還是煽動者。
美聯社指出，這份聲明顯示實際掌握埃及政權的軍事委員會，將進一步收緊對權力的掌控。這將激怒那些要求埃及結束軍人執政、過渡到民主政治的活動分子。
9日傍晚，科普特基督教徒因為不滿南部阿斯旺省一座教堂遭伊斯蘭教徒襲擊，而在開羅市中心國家電視臺大樓前舉行和平示威。示威者隨后與軍警發生沖突。后來，國營電視臺稱基督教徒試圖破壞人民和軍方之間的團結而呼吁伊斯蘭教徒前往支持，令基督教徒受到大群伊斯蘭教徒圍攻，結果沖突變得一發不可收拾。
