為進一步擴大對臺青少年交流規模，加深兩岸青年的了解與共識，自2006年始，全國青聯于每年暑期舉辦“兩岸青年聯歡節”，此項活動已經成為兩岸青年學生開展大規模交流的品牌活動。
2006年，全國青聯與廈門市政府共同舉辦了首屆青年聯歡節，共有1008名臺灣大學生參加，5家臺灣青少年社團參與；2007年，在北京等8個省市舉辦了第二屆聯歡節，共有2656名臺灣青年學生參加，來自臺灣全部23個縣市、56所大中學校，其中1/3來自中南部，有19家臺灣青少年社團組織和高校參與；2008年，在湖北等6個省市舉辦了第三屆聯歡節，共有2002名臺灣青年學生參加，來自臺灣48所大中學校，有17家臺灣青少年社團組織和高校參與。賈慶林同志曾為活動發賀信，全國人大常委會副委員長許嘉璐、全國政協副主席羅豪才等國家領導人曾出席活動。
聯歡節活動主要有五方面內容：一是體現奧運主題的活動，如奧運倒計時一周年兩岸千名學子匯西湖、參觀奧運場館、兩岸青年迎奧運排球、籃球友誼賽等活動；二是體現中華文化主題的活動，如在河北涿鹿中華三祖堂（黃帝、炎帝、蚩尤）、湖南株洲炎帝陵、南京中山陵的拜祭先祖和拜謁偉人儀式，參觀故宮、岳麓書院等歷史名勝古跡活動；三是體現發展主題的活動，如參觀深圳、蘇州等地的工業、科技園區，考察寶鋼集團、富士康集團等知名企業；四是體現民族情緣主題的活動，如黎族“嬉水節”狂歡、閩南民俗文化踩街等民俗活動；五是體現交流主題的活動，如“青春航標”成長分享會、兩岸青年學生領袖座談會和各類素質拓展歷奇活動等多種形式的校園交流。
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