馬英九再次當選黨主席,是在他高票贏下2008年臺灣“大選”之后。當時,馬英九已執政一年,為促進黨政緊密合作,他在2009年宣布參選國民黨黨主席,并以93.87%的高得票率當選。當時的輿論認為,拿回國民黨大權的馬英九,終于要開啟“黨政一把抓”的時代,協調、理順“黨政”關系和“行政立法”關系,施政理念難以落實的局面將有所改觀。